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Never too old to learn.

[CV]

I'm very interested in biostatistics. ONE of my goals now is to seek opportunity to pursue a Ph.D. degree of biostatistics before 40 years old. Not too old yet?

There are my learning experience, my thoughts, my ideas and my codes shared in this website. If you like, feel free to leave comments.

EDC system in China

Posted on Mar 30 , 2012 by youjoy

The use of EDC(electronic data capture) system in clinical trials is very common in America and Europe. In China the developement of EDC is slow. Except the expensive price, I think there are other factors that hindered the developement of EDC system.

In my oppinion, one of the factors is that there is no standard, whatever the standard of clinical trial database or standard of its submitting to regulatory. Another is that many investigators have no enough staff to conduct a trial based on EDC. The third, perhaps the primary factor, most of sponsors haven't a fully understand of the need of EDC. 

The advantage of using EDC is obvious and using EDC is a general trend. How to convert this big potential market to real needs? If you can find this answer you will get the profitable clients.

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A SAS bug?

Posted on Mar 30 , 2012 by youjoy

I use SAS 9.1.3 to calculate survival time median and it's 95%CI with KM method. Here is the survival dataset.

The codes is very simple:

proc lifetest data=survival method=km;
time survdays*censored(1);
strata group;
run;

Results are as follows:

Stratum 1: group = a
...
Quartile Estimates
                                       Point     95% Confidence Interval
                          Percent    Estimate      [Lower      Upper)
                               75     3.00000     2.00000     4.00000
                               50     2.00000     2.00000     3.00000 
                               25     2.00000     1.00000     2.00000
Stratum 2: group = b
...
Quartile Estimates
                                       Point     95% Confidence Interval
                          Percent    Estimate      [Lower      Upper)
                               75     5.00000     4.00000     6.00000
                               50     3.50000     2.00000     5.00000 
                               25     1.50000     1.00000     3.00000

But in SAS 9.2 , with the same dataset and the same codes I get different values.

Output in SAS 9.2:

Stratum 1: group = a
...
Quartile Estimates
                                Point          95% Confidence Interval
                   Percent    Estimate    Transform      [Lower      Upper)
                        75     3.00000    LOGLOG        2.00000     4.00000
                        50     2.00000    LOGLOG        1.00000     3.00000 
                        25     2.00000    LOGLOG        1.00000     2.00000
Stratum 2: group = b
...
Quartile Estimates
                                Point          95% Confidence Interval
                   Percent    Estimate    Transform      [Lower      Upper)
                        75     5.00000    LOGLOG        3.00000     6.00000
                        50     3.50000    LOGLOG        1.00000     5.00000 
                        25     1.50000    LOGLOG        1.00000     3.00000

I noticed a added column named Transform in SAS 9.2 output. Using powerful google. I know why the result is different.

Beginning in SAS 9.2, the default transformation type applied to s(t ) to obtain the confidence intervals for the quartiles of the survival times in lifetest procedure is LOGLOG . But in SAS 9.1.3 the transformation type is ASINSQRT . For more information, you can visit this page and this.

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临床试验的知情同意,我们应该了解更多

Posted on May 19 , 2012 by 无我

临床试验知情同意过程极其重要,在当今国内医患关系尤其紧张的情况下,临床试验的知情同意,对于保护医(研究者)患(受试者)双方的利益都至关重要。那么知情同意到底是什么,仅仅是患者在《知情同意书》上面签字确认就是知情意同意吗?

事实上知情同意过程所包含的,要比一纸《知情同意书》多得多。

临床试验的知情同意

首先,病人的同意,必须是在不受任何压力,且具备决定能力的情况下做出的决定。当然同意的确认,肯定是以签署书面同意为依据的,即上面提到的《知情同意书》。

其次,知情同意过程,不仅仅是在试验开始前研究者向受试者介绍试验的相关信息,也包括试验期间,研究者采取适当方式,使受试者清楚地了解自身病情和试验药物(方法)的相关进展与事项。这些试验前、试验进行当中患者应该了解到的信息包括以下几个方面:

(1)临床试验的目的、方法及相关检验检查。

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25年后,还有什么没改变

Posted on Apr 20 , 2012 by 无我

清明回家,母亲找出这张相片。 看着发黄的照片上这些熟悉的面孔,想哭。

因为再也回不到从前。25年的岁月,几乎改变了一切...

今年再有时间回去的话,记着联系你的同学们,那曾经的纯粹的友谊,是你人生中最大的财富。

57小学87届6.2班合影

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这两天成绩就陆续出来了

Posted on Apr 15 , 2012 by 无我

英语原始分比自己原先预计的低了4分。别人都说今年英语题有点难,因为自己考前做蒋跃的模拟题直到崩溃,所以考下来竟然觉得题还算容易!

专业课应该下周出,概率论与数理统计考得一塌糊涂,医学统计学感觉还好。无论能否上线,将来定要恶补数学,许多基础的东西都还给老师了,

漫长的等待何时能结束?

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名与利 - 追求理想过程中的副产物

Posted on Aug 18 , 2011 by 无我

研修班的经历已经过去几年了,老师们讲授的知识,也已经有许多还给了他们。不过至今仍清晰记得政治老师在课上讲的一席话,意思大抵就是说:名与利,应该是追求理想过程中的副产物。

必须承认,现在的社会就是一个追名逐利的社会,在这样的社会背景下,名利成为许多人的人生目标,而且其中相当一部分人为了实现自己的“人生目标”而不惜使用各种手段,这也是当今中国社会受人诟病的主要原因。现在中国的学术界,亦是甚嚣尘上,真...

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统计推断的前提-同质性假设

Posted on Aug 5 , 2011 by 无我

无论是哪种统计方法,其统计推断的前提,即最基本的假设,是研究对象的同质性(homogeneity),通俗点说,研究对象应该是大同小异,存在共性。以共性为前提,抽样研究才具有科学性,那些统计推断的结论才可能正确。

所以在统计设计与实施过程中,应保证所抽取的样本与总体之间,在共性问题上没有明显的不同。这一点如何做到又如何证明?恐怕哈佛的统计学家们也不能给你一个答案(ref:click here)。这里更多的可能是你的经验。举个例子:你要研究A城市HIV感染人群的分布情况,不管如何设计与实施,我们很清楚:如果样本只来自夜总会、洗浴中心,你得出的结论很可能让人吃惊。

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美国华人教授-给我一千万也不海归!

Posted on Apr 27 , 2011 by 无我

我很少转载别人的文章,这篇文章看过看感触很多,所以就转了过来(没经作者同意,不会有问题吧?)

原文链接:http://blog.qq.com/qzone/3982111/1305648182.htm

海归海不归,是海外华人永远的心结。几个留学美国的学生,拍了一部电影《不如归去》,就是说的这个。

经常有人问:你会海归吗?我的回答是:给我一千万人民币也不海归!

最近,国内一所新型的大学,要引进美国的办学理念,...

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Enter to grow in wisdom

Posted on Apr 26 , 2011 by 无我

Dexter Gate is in harvard campus.

Two inscriptions by Harvard President Charles William Eliot adorn the gate itself: on the outside, "Enter to grow in wisdom"; on the inside, "Depart to...

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解决SAS ERROR: WORK UTILITY的永久副本已删除

Posted on Apr 20 , 2011 by 无我

从SAS9.1开始(包括SAS9.2),在使用时可能会出现类似这样的错误日志:

ERROR: 文件“WORK._tf0007.UTILITY”的永久副本已删除。
NOTE: SAS 系统由于错误而停止了该步的处理

SAS的这个运行错误与使用杀毒软件,比如卡巴斯基有关,解决方法也很简单:

第一步,确认SAS.exe是否在“受信任组”中,如果不是,添加到受信...

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SAS 9.2与SAS9.13有哪些不同

Posted on Apr 8 , 2011 by 无我

最近刚开始接触9.2版本的SAS,根据介绍9.2较9.13有许多重要的改进 ,今天一个实际的问题 让我领略了两个版本之间的差异。

SAS确实强大也绝对庞大,对于临床试验的统计分析而言,也只使用其中一小部分功能而已,所以这种版本间的差异,除非遇到具体的问题,否则不会去关注也不可能知道。

对于生存分析(lifetest过程步)中生存时间的四分位数可信区间的计算...

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君子爱财,取之正道

Posted on Apr 4 , 2011 by 无我

古人讲:君子爱财,取之有道 。现如今爱财者甚多,取之也有各种各样的道,只是此道非彼道。

从天津回家的途中,遇到一位老乡,这位老弟很健谈,而我也很乐意在短暂的旅途中有个人聊聊天。

到了我们这个年龄,谈到钱是很自然的事,然后就很自然地谈到他的老板,也是我们一个老乡,是如何发家的。我相信,每一个成功的老板背后,都有一个故事,这故事的结尾也总是能够让人兴奋,尤其是在物欲横流的当今社会,3W一条的腰带,几百W的...

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